Le GBIF France a pour rôle, entre autres, d’assurer la transmission de données françaises vers l’international. Pour cela, il collabore avec plusieurs infrastructures au niveau national pour les données de biodiversité. Le paysage français comprends des portails, des entrepôts et des catalogues de métadonnées. Selon vos objectifs et votre situation, ce seront vos interlocuteurs privilégiés. Contactez-nous pour plus d’informations.
Systèmes d’infomations
SIB
Le Système d’information sur la biodiversité (SIB) est un dispositif conçu pour rassembler et centraliser les données provenant de 31 politiques publiques liées aux enjeux de la biodiversité. Chaque politique est associée à son propre système d’information, appelé “Système d’information métier”. Parmi ces systèmes figurent, par exemple, le Système d’information de l’inventaire du patrimoine naturel (SINP), celui de la CITES, ou encore celui de Natura 2000.
SINP
Le SINP (Système d’information de l’inventaire du patrimoine naturel) a pour mission de structurer les connaissances sur la biodiversité (incluant les espèces de la faune, de la flore et de la fonge) ainsi que sur les habitats naturels ou semi-naturels, mais aussi sur la géodiversité. L’objectif est de rendre ces connaissances accessibles à tous. Le SINP couvre l’ensemble du territoire national, métropole et outre-mer, et englobe les domaines terrestre, aquatique et marin.
Les données ainsi partagées, sous forme structurée, sont particulièrement utiles pour l’élaboration et le suivi des politiques publiques, la prise de décision démocratique, ainsi que pour les rapportages européens concernant l’état des populations et des écosystèmes.
Portails de diffusion
Reeftemps
Reeftemps est un Suivi à long terme du changement climatique et de ses effets sur l’état des récifs coralliens et de leurs ressources dans la région Pacifique Étudier le climat à grande échelle et les variations climatiques régionales et locales du domaine côtier des différents états insulaires du Pacifique Sud et Sud-Ouest et Ouest au travers des séries temporelles, principalement de température de l’eau de mer.
SEANOE
SEANOE est une solution de publication des données environnementales scientifiques marines créée par The French NODC. Elle permet aux scientifiques de publier, en libre accès, un jeu de données et de le citer de manière fiable et pérenne dans un article. Il pourrait s’intégrer également à l’effort national pour la mise en place d’une infrastructure de gestion coordonnée des données d’observation de la terre et plus spécifiquement au Pôle Océan. Un pas en avant vers l’Open Science, pour un accès gratuit aux publications scientifiques et aux données de la recherche.
Odatis-ocean
Le pôle de données et de services pour l’océan “Odatis”, fédère au niveau national des activités de gestion de données et d’expertise scientifique en océanographie. Il a pour objectif général de promouvoir et faciliter l’utilisation des données d’observations réalisées dans l’océan ou à son interface avec les autres milieux, à partir de mesures in situ et de télédétection. ODATIS contribue ainsi à décrire, quantifier et comprendre l’océan dans sa globalité, hauturier et côtier.
IRD Média
IRD Média Des milliers d’images, de sons et de vidéos sur les sciences et le développement durable. Filtrer par zones géographiques.
LAGPLON
LAGPLON, créé par le Service plongée de l’ORSTOM de Noumea, Lagplon est un système d’information de la biodiversité marine des récifs et lagon de Nouvelle-Calédonie et d’autres régions de l’Indo Pacifique.
INPN et OpenObs
L’Inventaire national du patrimoine naturel (INPN) est la plateforme de référence sur l’état et la conservation de la biodiversité et de la géodiversité française, en métropole et outre-mer aussi bien sur le terrestre que le marin. Le site de l’INPN diffuse et valorise les connaissances concernant les espèces (faune, flore, fonge), les milieux naturels et les habitats, les espaces protégés et le patrimoine géologique. Ces données de référence, validées par des réseaux d’experts, sont mises à la disposition de tous, professionnels, décideurs et citoyens. L’INPN constitue la plateforme nationale du système d’information de l’inventaire du patrimoine naturel (SINP).
OpenObs est un outil de l’écosystème INPN dédié à la diffusion de données d’observation sur les espèces. Il permet notamment la visualisation, l’exploration et le téléchargement de données. OpenObs est basé sur les modules d’Atlas of Living Australia, portés par le collectif Living Atlases, au sein de la communauté GBIF.
Infrastructures de recherche
PNDB
Le Pôle National de Données de Biodiversité (PNDB) est le pôle de données et services de la thématique biodiversité de l’infrastructure de recherche (IR) Data-Terra pour le système Terre-Environnement du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche, du noeud thématique Environnement de l’EOSC (European Open Science Cloud).
RECOLNAT
Le Réseau national des collections naturalistes RECOLNAT est une infrastructure de recherche (IR) dédiée à la gestion et à la valorisation des collections d’histoire naturelle à travers la recherche scientifique. Depuis 2016, RECOLNAT est inscrit sur la feuille de route des infrastructures du ministère de la Recherche (MESRI). Sa mission principale est de produire et de rendre accessible un vaste ensemble de données au service de l’étude de la biodiversité et de la géodiversité, tant actuelle que passée.
Entrepôts
Pour les données issues de la recherche
Le GBIF est considéré comme un entrepôt de confiance par le Comité pour la Science Ouverte, et est un Global Core Biodata ressource. En plus du GBIF, pour les données de biodiversité, les entrepôts listés ci-dessous peuvent correpondre à vos attentes.
Odatis ocean
Le catalogue des données et produits du Pôle ODATIS permettent de découvrir les jeux de données fournis par la communauté nationale et leurs liens avec les programmes internationaux. Ce catalogue propose plusieurs outils de services d’accès aux données : un service de recherche avec des filtres de sélection, un service de description de la donnée (via deux onglets : “Aperçu” et “Complet”), un service de visualisation, et un service de téléchargement direct ou via le portail local des partenaires.
Plus d’information dans le Guide d’utilisation Sextant (édition IFREMER) et dans une courte vidéo (53 secondes) appliquée à un jeu de données du Pôle ODATIS.
SEANOE
SEANOE est une solution de publication des données environnementales scientifiques marines créée par The French NODC. Elle permet aux scientifiques de publier, en libre accès, un jeu de données et de le citer de manière fiable et pérenne dans un article. Il pourrait s’intégrer également à l’effort national pour la mise en place d’une infrastructure de gestion coordonnée des données d’observation de la terre et plus spécifiquement au Pôle Océan.
data.InDoRES
Placée sous la responsabilité de l’Institut Écologie et Environnement, du CNRS et du Muséum national d’Histoire naturelle, la plateforme InDoRES propose plusieurs services :
- Permettre de découvrir diverses bases et jeux de données grâce à une présentation détaillée des projets qui les génèrent. Ce catalogue de métadonnées, standardisé et interopérable, est conçu pour répondre aux directives européennes. Lorsque cela est possible, des liens sont fournis pour accéder aux données téléchargeables ou aux publications associées.
- Donner accès à l’entrepôt sécurisé data.InDoRES, permettant aux chercheurs de publier leurs données.
- Réunir et orienter vers une sélection de ressources dédiées aux bonnes pratiques qui favorisent le partage et la réutilisation des données, en accord avec les principes FAIR (Faciles à trouver, Accessibles, Interopérables, Réutilisables).
DataSuds
L’entrepôt de données DataSuds offre aux scientifiques de l’IRD et à leurs partenaires un service destiné à diffuser, préserver et valoriser leurs données de recherche, tout en facilitant leur identification et leur citation. Il s’inscrit comme un élément clé du dispositif de la science ouverte pour le Sud, soutenu par l’IRD.
Recherche Data Gouv
Recherche Data Gouv est un écosystème conçu par et pour les établissements de l’enseignement supérieur et de la recherche. Il vise à accompagner les chercheurs dans la gestion, le partage et l’ouverture de leurs données de recherche, contribuant ainsi à une science plus cumulative et accessible à tous.
Catalogues
Cat.InDoRES
Cat.InDoRES est un catalogue de métadonnées partagé, qui regroupe à la fois les fiches d’InDoRES et celles des réseaux des Observatoires Hommes-Milieux (OHM - LabEx DRIIHM) ainsi que des Zones Ateliers (RZA - eLTER). Ce catalogue propose des métadonnées standardisées pour faciliter la découverte de jeux et bases de données. Le projet bénéficie du soutien du Muséum national d’Histoire naturelle et de l’Institut Écologie et Environnement du CNRS.